Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms