Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf53Q8N6V4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf53Q8N6V4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms