Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms