Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WDR44Q5JSH3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms