Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SGO1Q5FBB7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGO1Q5FBB7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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