Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPL39P5Q59GN2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms