Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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IRF4Q15306 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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IRF4Q15306 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IRF4Q15306 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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