Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ACACAQ13085 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ACACAQ13085 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ACACAQ13085 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ACACAQ13085 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACACAQ13085 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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