Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FOXF2Q12947 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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