Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms