Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RAD23AP54725 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAD23AP54725 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms