Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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