Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOT1P17174 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOT1P17174 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms