Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ZNF208O43345 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF208O43345 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF208O43345 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF208O43345 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF208O43345 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF208O43345 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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