Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms