Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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