Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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