Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms