Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MS4A7Q9GZW8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MS4A7Q9GZW8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms