Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC11Q96DB2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms