Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms