Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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