Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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