Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TUBA3CQ13748 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TUBA3CQ13748 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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