Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms