Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBE1Q04446 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms