Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ERVFRD-1P60508 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVFRD-1P60508 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms