Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CHRNA7P36544 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms