Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCR1P32246 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms