Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms