Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CYP2C19-201ENST00000371321 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms