Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLC28A2O43868 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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