Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GKN1Q9NS71 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GKN1Q9NS71 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms