Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms