Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms