Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGAP1Q96PV0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGAP1Q96PV0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms