Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS6Q96GS4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms