Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms