Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TTC21AQ8NDW8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms