Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KBTBD3Q8NAB2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KBTBD3Q8NAB2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms