Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CATSPER4Q7RTX7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms