Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC1Q4VXA5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC1Q4VXA5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC1Q4VXA5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC1Q4VXA5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC1Q4VXA5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KHDC1Q4VXA5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms