Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LTC4SQ16873 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms