Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC37Q16543 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms