Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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