Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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IKZF1Q13422 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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IKZF1Q13422 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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IKZF1Q13422 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IKZF1Q13422 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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