Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UBE2V1Q13404 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms