Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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