Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IFITM3Q01628 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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