Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms